Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms