Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms