Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms