Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms