Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crisp3Q03402 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms