Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms