Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GscQ02591 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GscQ02591 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GscQ02591 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GscQ02591 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GscQ02591 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GscQ02591 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GscQ02591 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GscQ02591 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GscQ02591 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GscQ02591 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms