Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms