Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms