Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec23aQ01405 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms