Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2aQ01320 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms