Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms