Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SelpQ01102 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SelpQ01102 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms