Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grin2bQ01097 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grin2bQ01097 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms