Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brca2P97929 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms