Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlkP97793 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlkP97793 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlkP97793 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AlkP97793 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AlkP97793 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
AlkP97793 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AlkP97793 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AlkP97793 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AlkP97793 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AlkP97793 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AlkP97793 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AlkP97793 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AlkP97793 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AlkP97793 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlkP97793 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms