Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms