Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps45P97390 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps45P97390 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms