Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms