Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnikP83510 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnikP83510 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnikP83510 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnikP83510 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnikP83510 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms