Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux2P70298 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cux2P70298 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux2P70298 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms