Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms