Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf6P70279 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms