Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Traf5P70191 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf5P70191 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms