Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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