Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms