Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpfP62307 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms