Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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