Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms