Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms