Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf3P61205 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms