Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms