Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pcbp4P57724 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp4P57724 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms