Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TdgP56581 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TdgP56581 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TdgP56581 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TdgP56581 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TdgP56581 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TdgP56581 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TdgP56581 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TdgP56581 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TdgP56581 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TdgP56581 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TdgP56581 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TdgP56581 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms