Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms