Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GemP55041 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GemP55041 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GemP55041 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms