Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux1P53564 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms