Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms