Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms