Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms