Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms