Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms