Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmx2P43687 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms