Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms