Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
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