Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KdrP35918 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KdrP35918 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KdrP35918 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KdrP35918 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KdrP35918 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KdrP35918 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KdrP35918 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KdrP35918 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms