Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnar1P33896 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnar1P33896 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms