Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms