Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Etv4P28322 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Etv4P28322 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms