Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CftrP26361 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CftrP26361 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CftrP26361 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CftrP26361 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CftrP26361 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CftrP26361 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CftrP26361 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CftrP26361 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CftrP26361 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CftrP26361 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CftrP26361 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
CftrP26361 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
CftrP26361 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CftrP26361 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CftrP26361 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CftrP26361 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CftrP26361 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CftrP26361 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms